Alors que chez le blé, les fongicides DMI, tels que le tébuconazole et le prothioconazole, permettent de lutter efficacement contre les maladies de l'épi de Fusarium, dans le maïs, aucune suppression chimique par pulvérisation n'est disponible sur le terrain. Étant donné que l'inoculum transmis par les semences contribue à la pression d'infection globale, le traitement des semences peut être suggéré comme mesure d'hygiène, en particulier lorsque la semence est gravement infestée par G. zeae. La lutte contre les insectes nuisibles tels que les perce-oreilles pour le maïs réduira également l'infection de l'oreille causée par les blessures causées par l'alimentation par les insectes.