De fortes doses d’anti-infectieux (type sulfamides) dans les trois premiers jours de la maladie permettent de limiter les symptômes. Cependant, l’animal reste porteur du parasite et source de contamination pour le troupeau. Après cette période initiale, les traitements ne sont plus que symptomatiques. Si de la besnoitiose est identifiée dans un foyer, la seule action préventive réalisable est la lutte contre les insectes piqueurs avec des produits à pulvériser ou à verser sur le dos, mais son efficacité est faible sur les taons. Il faut également changer d’aiguille entre chaque bovin lors des traitements.