L’agriculture actuelle est confrontée à de nombreux enjeux environnementaux, sociaux et techniques, et la volonté de réduire les effets négatifs sur l’environnement et la santé humaine amène les acteurs du monde agricole, les politiques et les citoyens à se positionner pour une évolution des mentalités, des pratiques et des modes de consommation. Si l’agroécologie est un « ensemble de pratiques agricoles basées sur l’écologie », elle implique des changements d’ordre technique et scientifique mais est obligée de s’envisager comme une relation interconnectée entre sciences et société, dépassant alors les simples systèmes de production pour englober l’ensemble des systèmes agri-alimentaires : en associant à la dimension de production agricole, l’organisation des filières sur le territoire et la commercialisation.