Le risque fusariose dépend très largement d'un climat pluvieux. C’est la principale cause d’apparition de la maladie. Les Fusarium sont favorisés par une forte humidité ou une période pluvieuse persistante pendant plusieurs jours entre la période épiaison-début floraison. Un court épisode pluvieux à la floraison, précédé d’une période sèche n’est pas suffisant pour l’installation de la maladie. Mais sa gravité reste pour une part liée au potentiel infectieux du sol et à la sensibilité variétale liée au risque Fusarium graminearum et non Microdochium. La rotation a une grande importance dans la maîtrise du risque d’infection par F. graminearum. Parce qu’ils laissent derrière eux des résidus contaminés, les précédents sensibles comme le maïs ou le sorgho sont des vecteurs de la maladie.