Dans le maïs, la variabilité de la résistance génétique à la production de tige, de pourriture des oreilles et de désoxynivalénol a été décrite. Le niveau de résistance semble toutefois souvent insuffisant. Le labour au printemps réduit considérablement la pourriture du maïs; Cependant, les effets sur la colonisation des épis et la pourriture de l'oreille sont moins prononcés. Le contrôle de cette maladie peut être obtenu en combinant les stratégies suivantes: applications de fongicides, reproduction par résistance, stockage approprié, rotation des cultures, travail du sol et traitement des semences. L'utilisation correcte des applications de fongicides contre la brûlure de l'épi causée par Fusarium peut réduire la maladie de 50 à 60%.