La source de l’inoculum et des pratiques de culture sont des facteurs déterminants pour mettre en place des mesures visant à réduire l'inoculum initial d'une nouvelle culture. Lorsque le maïs est cultivé de manière continue dans les environs, les efforts d'assainissement ne seront probablement pas efficaces. Il faut une rotation des cultures. Ailleurs, il peut être approprié de retirer les plantes volontaires ou les parents de maïs sauvage. Les ascospores de Phyllachora maydis ont survécu dans les débris de culture pendant trois mois ou plus; l'enlèvement ou la destruction des débris peut être utile si une nouvelle culture sera plantée dans cet intervalle.