Si un danger menace la production, l’agriculteur biologique est autorisé à utiliser certains produits d’origine naturelle. Les semences, matériels de reproduction végétative et plants. Les semences, les matériels de reproduction végétative et les plants biologiques doivent être utilisés. En cas de non disponibilité en bio, des dérogations peuvent être accordées pour les semences. Quelques cas de figure peuvent donner droit à une dérogation pour utiliser des semences non-bio et non traitées, mais elle doit être validée avant d’acheter les semences. L’utilisation d’Organismes Génétiquement Modifiés (OGM) est interdite.