Les pratiques de lutte culturale sont adéquates pour prévenir Alternaria helianthi. Il s’agit de détruire de résidus végétaux pour éliminer la source d'inoculum; la rotation des cultures avec des cultures non Asteraceae; et tenir compte des périodes de jachère. De plus, il est fortement recommandé d’ajuster le temps de semis afin qu’il ne coïncide pas avec la saison des pluies, la solarisation du pétrole et l’assainissement des champs afin de réduire les infections par Alternaria. Le contrôle chimique n'est généralement pas nécessaire dans les zones à faible taux d'humidité. Pour obtenir les meilleurs résultats, une combinaison de contrôle culturel et chimique doit être mise en œuvre.