Les rotations de culture, la jachère, le choix de semences de haute qualité sont des moyens efficaces de limiter ce nématode, de même que les mises en quarantaine de céréales exportées par des pays où le ravageur est présent ou aurait réémergé. Les dégâts causés par l’anguillule du blé niellé sont aujourd’hui mineurs dans les pays où les semences sont correctement triées (nettoyage mécanique permettant de séparer les grains plus petits porteurs de nématodes).