Plusieurs espèces d'insectes endoparasitoïdes attaquent le puceron vert du pommier. Parmi ceux-ci on retrouve cinq espèces d'hyménoptères de la famille des Braconidae : Binodoxys angelicae, Ephedrus persicae, Ephedrus plagiator, Lysiphlebus fabarum et Monoctonus cerasi. Parmi les prédateurs, on retrouve la cécidomyie du puceron (Aphidoletes aphidimyza), une petite mouche de la famille des Cecidomyiidae. Ses larves sont des prédatrices qui s'attaquent à plusieurs espèces de pucerons. La larve de cécidomyie du puceron peut tuer jusqu'à une soixantaine de pucerons par jour.