Le contrôle biologique consiste à réduire la taille des lésions de P. maydis due à l'hyperparasitisme peu de temps après l'infection suggère que Coniothyrium phyllochorae pourrait être utilisé comme témoin. Pour lutter contre Phyllachora maydis, les producteurs ont eu souvent recours à l’utilisation des pesticides chimiques. Le fenpropimorphe et le mancozèbe appliqués tous les 10 jours se sont avérés être les fongicides les plus efficaces lors des tests menés sur des parcelles de terrain au Mexique.