L’infection à la marbrure jaune du riz peut se combattre par des pesticides agissant contre les insectes vecteurs, ou en repiquant précocement, en réduisant l’écart entre les plants ou encore en détruisant après la récolte les résidus de plants de riz et repousses pouvant héberger les virus et les insectes vecteurs. On peut planter des variétés résistantes ou tolérantes à la marbrure jaune. D’autres méthodes de contrôle sont la synchronisation des semis, la diversification des variétés sur une parcelle, le déplacement des pépinières, l’arrachement des plants infectés et leur repiquage immédiat, la réduction d’apport d’azote sur les parcelles attaquées et la réduction des plantes réservoirs de virus et insectes vecteurs.