Le MCPA est utilisé comme herbicide, généralement sous forme de sels ou d'esters. Ainsi utilisé, il permet de maîtriser les mauvaises herbes dicotylédones , y compris les chardons et les oseilles, dans les cultures de céréales et les pâturages.
Il est sélectif contre les plantes à feuilles larges, y compris la plupart des arbres à feuilles caduques. Les trèfles sont tolérants à des doses d'application modérées. Il est actuellement classé comme un pesticide à usage restreint aux États-Unis. Sa toxicité et sa biodégradation sont des sujets de recherche en cours. Bien qu'il ne soit pas extrêmement toxique, on a récemment déterminé que le MCPA peut former des complexes avec des ions métalliques et ainsi augmenter leur biodisponibilité, et des recherches sont en cours pour utiliser cette possibilité.