L’amétryne est légèrement toxique pour l'homme. Les symptômes d'une exposition aiguë à des doses élevées comprennent les nausées, les vomissements, la diarrhée, la faiblesse musculaire et la salivation.
Ametryn est modérément irritant pour les yeux, la peau et les voies respiratoires. La toxicité aiguë de cet herbicide devrait être faible et aucun effet nocif de l'exposition n'a été observé et rapporté. Il peut être absorbé par voie orale, cutanée et par inhalation.