L'azinphos-méthyl peut pénétrer dans l'organisme par inhalation, par ingestion ou par contact cutané.
L'ingestion d'azinphos-méthyl est responsable de l'exposition à faible dose à une grande partie de la population, en raison de sa présence sous forme de résidus dans les aliments et l'eau de boisson. Après ingestion, il peut être absorbé par le tube digestif. Par contact avec la peau, l’AzM peut également pénétrer dans le corps par l’intermédiaire de cellules du derme. L'absorption par la peau est responsable de l'exposition professionnelle à des doses relativement élevées, principalement chez les travailleurs de l'agriculture. Il est également possible d’être exposé en se rendant dans des champs qui viennent d’être pulvérisés.